| bosque protector Palo Seco | Parque natural o regional | Panamá | Bocas del Toro | 1,674 km² | — | — |
| Cocobolo Nature Reserve | Reserva natural | Panamá | Guna Yala | — | — | — |
 Fortuna Forest Reserve | Reserva natural | Panamá | Chiriquí | 195 km² | — | — |
| Humedal Golfo de Montijo | Humedal | Panamá | Veraguas | — | VI | — |
| Humedal Lagunas de Volcán - Área Núcleo Reserva de la Biosfera La Amistad Panamá | Reserva de biosfera | Panamá | Chiriquí | — | — | — |
| Humedal San San Pond Sak | Humedal | Panamá | Bocas del Toro | — | — | — |
| Mangrove Reserve | Reserva natural | Panamá | Colón | — | — | — |
| Monumento Natural Barro Colorado | Monumento natural | Panamá | Panamá | — | III | — |
| Monumento Natural Cerro Gaital | Monumento natural | Panamá | Panamá | — | III | — |
| Parque de La Amistad Rotaria | Parque natural o regional | Panamá | Chiriquí | — | IV | — |
 Parque internacional La Amistad | Área protegida | Panamá | Bocas del Toro | 4,188 km² | II | 1988 |
 Parque nacional Altos de Campana | Parque nacional | Panamá | Panamá | 48.2 km² | II | 1966 |
 Parque nacional Camino de Cruces | Parque nacional | Panamá | Panamá | 47.9 km² | II | 1992 |
| Parque nacional Cerro Hoya | Parque nacional | Panamá | Veraguas | 0.3 km² | II | 1984 |
 Parque nacional Chagres | Parque nacional | Panamá | Panamá | 1,290 km² | II | 1985 |
 Parque Nacional Coiba | Parque nacional | Panamá | Veraguas | 503 km² | II | 1992 |
| Parque nacional Darién | Parque nacional | Panamá | Darién | 5,970 km² | II | 1980 |
| Parque nacional General de División Omar Torrijos Herrera | Parque nacional | Panamá | Colón | — | — | 1986 |
 Parque Nacional Isla Bastimentos | Área protegida | Panamá | Bocas del Toro | 130 km² | II | 1988 |
 Parque nacional marino Golfo de Chiriquí | Parque nacional | Panamá | Chiriquí | — | — | 1994 |
| Parque Nacional Marino Isla Bastimentos (PNMIB) - Área Núcleo Reserva de la Biosfera La Amistad Panamá | Parque nacional | Panamá | Bocas del Toro | — | II | — |
| Parque Nacional Omar Torrijos | Parque nacional | Panamá | Colón | — | — | — |
| Parque Nacional Portobelo | Parque nacional | Panamá | Colón | — | — | — |
| Parque Nacional Reverendo Padre Jesús Héctor Gallego Herrera | Parque nacional | Panamá | Veraguas | — | — | 2019 |
| Parque Nacional Santa Fé | Parque nacional | Panamá | Veraguas | — | — | 2001 |
 Parque nacional Sarigua | Parque nacional | Panamá | Herrera | — | — | 1984 |
 Parque nacional Soberanía | Parque nacional | Panamá | Panamá | 221 km² | II | 1980 |
 Parque nacional Volcán Barú | Parque nacional | Panamá | Chiriquí | 143 km² | II | 1976 |
 Parque natural metropolitano | Parque natural o regional | Panamá | Panamá | — | — | 1988 |
 Parque Recreativo Omar Torrijos | Parque natural o regional | Panamá | Panamá | — | — | 1982 |
| Refugio de Vida Silvestre - El Peñón de la Honda | Refugio de vida silvestre | Panamá | Los Santos | — | IV | — |
| Refugio de Vida Silvestre Cenegón del Mangle | Refugio de vida silvestre | Panamá | Herrera | — | IV | 1980 |
| Refugio de Vida Silvestre de Playa Boca Vieja | Refugio de vida silvestre | Panamá | Chiriquí | — | IV | — |
| Refugio de Vida Silvestre Humedal de Bahía de Panamá | Refugio de vida silvestre | Panamá | Panamá | — | IV | 2003 |
| Refugio de Vida Silvestre Isla Boná | Refugio de vida silvestre | Panamá | Panamá | — | — | — |
| Refugio de Vida Silvestre Isla Cañas | Refugio de vida silvestre | Panamá | Los Santos | — | — | 1994 |
| Refugio de Vida Silvestre Isla de Taboga - Urabá | Refugio de vida silvestre | Panamá | Panamá | — | — | 1984 |
| Refugio de Vida Silvestre Isla Iguana | Refugio de vida silvestre | Panamá | Los Santos | — | — | 1989 |
| Refugio de Vida Silvestre Pablo Barrio | Refugio de vida silvestre | Panamá | Los Santos | — | — | 1992 |
| Refugio de Vida Silvestre Playa de La Barqueta Agrícola | Refugio de vida silvestre | Panamá | Chiriquí | — | IV | — |
| Reserva Forestal de Barú | Reserva forestal | Panamá | Chiriquí | — | — | — |
| Reserva Forestal de Fortuna (RFF) | Reserva forestal | Panamá | Chiriquí | — | VI | — |
| Reserva Forestal El Montoso | Reserva forestal | Panamá | Herrera | — | — | — |
| Reserva Forestal La Laguna De La Yeguada | Reserva forestal | Panamá | Veraguas | — | VI | — |
| Reserva Forestal La Tronosa | Reserva forestal | Panamá | Los Santos | — | — | 1977 |
| Reserva Forestal Tonosí | Reserva forestal | Panamá | Los Santos | — | — | 1960 |
| Reserva Marino Costera Manglares de Panamá Viejo | Área marina protegida | Panamá | Panamá | — | — | 2015 |
| Reserva Municipal de Playa Bluff | Reserva natural | Panamá | Bocas del Toro | — | — | — |
| Reserva Natural de la Sociedad Civil Tacarcuna | Reserva natural | Panamá | Guna Yala | — | V | — |
 Reserva Natural Punta Patiño | Reserva natural | Panamá | Darién | — | — | 1993 |
| Río Limbo border to protected area | Humedal | Panamá | Colón | — | — | — |
| Zona de Reserva Playa La Marinera | Área marina protegida | Panamá | Los Santos | — | — | 2010 |
| Zona Especial de Manejo Marino Costero Archipiélago de Las Perlas | Área marina protegida | Panamá | Panamá | — | — | 2007 |
| Zona Especial de Manejo Marino Costero Isla Galera | Área marina protegida | Panamá | Panamá | — | — | 2007 |
| Zona Especial de Manejo Marino Costero Roca Trollope | Área marina protegida | Panamá | Darién | — | — | 2007 |
| Zona Especial de Protección Marina Isla Montuosa y Banco Hannibal | Área marina protegida | Panamá | Veraguas | — | — | 2009 |
| Área de Uso Múltiple Subcuenca del Río Mensabé | Humedal | Panamá | Los Santos | — | — | 2008 |
| Área Silvestre de Narganá | Área protegida | Panamá | Guna Yala | 954 km² | — | 1994 |
Volcán Barú
Volcán La Yeguada
Volcán El Valle